Vak: Biochemie in Beeld credits: 10
- Vakcode
- BFVP22BIOCHEMIE
- Naam
- Biochemie in Beeld
- Studiejaar
- 2023-2024
- ECTS credits
- 10
- Taal
- Nederlands
- Coördinator
- S.M. Nabuurs
- Werkvormen
-
- Projectonderwijs
- Werkcollege
- Toetsen
-
- Eindopdracht - Overige toetsing
- Python & Biochemie opdrachten - Overige toetsing
Leeruitkomsten
Je maakt zelfstandig eenvoudige programma’s waarin je correct gebruik maakt van bibliotheken en functies, en zelfgeschreven Python modules
Je kan rekenen met en begrijpt eenvoudige wiskundige formules met o.a. logaritmes en exponenten en kan die je ook kan toepassen in Python programma’s
Je kan data visualiseren met Python
Je beheerst basiskennis van de chemie zodoende dat je eenvoudige chemische structuren begrijpt en chemische reactievergelijkingen en berekeningen kan uitvoeren
Je begrijpt de structuur van een eiwit op verschillende niveaus en visualiseert een zelf gekozen eiwit met als doel structuur en functie van dit eiwit op verschillende niveaus te begrijpen
Je weet in welke databases je inhoudelijke informatie over eiwitten kan vinden en kan deze databases gebruiken om de juiste informatie en data over het eiwit in je eindproduct te vinden.
DAS competenties
Competentie
Niveau (I-IV)
Onderzoeken
I
Experimenteren
Ontwikkelen
Beheren
Adviseren
Instrueren | Begeleiden | Doceren | Coachen
Leidinggeven | Managen
Zelfsturing
I
Inhoud
In deze module leer je de basis van de wiskunde en chemie beheersen en ga je met een chemische bril kijken naar de werking van een eiwit. Eén manier van visualiseren is het maken van grafieken waarin je biologische data laat zien en deze data met de juiste wiskundige formules gaat beschrijven. Deze visualisatie schrijf je in Python. Een andere manier van visualiseren is het modeleren van chemische reacties, ook hier kun je een python programma voor schrijven. Als laatste gaan je laten zien hoe eiwitten (enzymen) eruitzien en waar in de structuur de reacties plaatsvinden. Deze visualisatie maak je met behulp van specifieke software die eiwitstructuren kan visualiseren.
Door de visualisatie van je eiwit kun je er ook achter komen of een mutatie in het gen dat codeert voor dit eiwit problemen met de werking kan veroorzaken.
Biologen produceren veel data met hun experimenten op eiwitten. Je gaat leren hoe je de data van simpele experimenten kan visualiseren en wiskundig kan benaderen. Hiervoor worden een basislessen wiskunde aangeboden. Op deze manier wordt ook de basis chemie die je nodig hebt in je opleiding aangeboden. Je wiskunde en chemie kennis wordt getoetst doormiddel van opdrachten in de lessen.
Om je visualisaties te kunnen maken heb je kennis nodig van Python, chemie en wiskunde. Om je te helpen de vaardigheden voor Python eigen te maken, worden er korte werkcolleges aangeboden waarbij de docent een en ander uitlegt en voordoet waarna je over de uitgelegde stof zelf een opdracht maakt. Deze opdrachten lever je in bij je docent die ze beoordeelt en met je bespreekt. Deze opdrachten moeten voldoende worden afgerond.
Opgenomen in opleiding(en)
School(s)
- Instituut voor Life Science & Technology