Vak: Metagenomics credits: 10

Deze module kent de volgende leeruitkomsten:   

• Gegeven een microbiële metagenomics dataset verdiep je je in de technieken en experimentele opzet die zijn gebruikt om deze te verkrijgen. Je kan relevante vragen stellen en een zinvolle discussie voeren over de opzet en uitvoering van het analyse traject.    
• Je ontwerpt, implementeert, documenteert en evalueert een metagenoom analyse pipeline.  
• Gegeven een onderzoeks(deel-)vraag selecteer je geschikte applicaties voor gebruik in je pipeline. Na het onderzoeken van de specificaties van de tools en het uitvoeren van een benchmark analyse maak je een weloverwogen keuze voor een tool.   
• Je voert fylogenetische analyses uit, en maakt daarbij relevante visualisaties. Je kan hier wetenschappelijke conclusies aan verbinden en verdedigen.    
• Je interpreteert je analyseresultaten in relatie tot de actuele wetenschappelijke kennis en kan dit effectief communiceren.    
• Je communiceert je resultaten met je opdrachtgever en klasgenoten door middel van het maken en ontwerpen van een poster.   
• Je kunt een wetenschappelijk artikel bespreken en participeert in discussies over het werk van jezelf en van anderen.    
• Je beschrijft de eigenschappen en (metabole) functies van micro-organismen en virussen en legt uit hoe deze, volgens actuele wetenschappelijke inzichten, bijdragen aan het functioneren van deze micro-organismen.